Más que como una mera disciplina técnica, la interpretación instrumental debe entenderse como una forma de expresión humana profundamente marcada por las circunstancias históricas, sociales y culturales en las que se ha manifestado. Es por eso que dicha práctica ha sufrido cambios notorios a lo largo del tiempo y que los experimenta también en la actualidad. La interpretación instrumental, por tanto, amerita un estudio sistemático en su propio derecho. El Programa de Maestría y Doctorado en Música de la UNAM se aboca precisamente a esta tarea, entendiendo la disciplina que resulta de esta inquietud como el estudio, análisis y recreación competente de obras musicales con base en la investigación de paradigmas estilísticos, contextos sociales, culturales, históricos y propiamente musicales.
El Programa de Maestría y Doctorado en Música pretende un equilibrio entre la práctica instrumental y los conocimientos teóricos que permiten su estudio como fenómeno cultural. Por tanto contempla seminarios de interpretación individual y en conjunto a la par de seminarios y actividades complementarias que abarcan terrenos como la teoría y metodología de la interpretación instrumental, el análisis aplicado a la interpretación y un campo amplio y abierto de disciplinas histórico-sociales vinculadas o vinculables a la interpretación musical, las cuales pueden cursarse en otros programas de posgrado de la UNAM o en otras instituciones de educación superior y centros de investigación musical, humanística o científica con los que la institución tenga convenios de colaboración académica.